FC Florești va evolua alături de alte 7 echipe în noua competiție inițiată de Federația Moldovenească de Fotbal – Cupa de Iarnă. Formația din nordul Moldovei va juca în seria B, alături de CF Univer, CSF Spartanii-Sportul și FC Iskra. Primul meci, FC Florești îl va disputa pe 1 februarie cu FC Iskra, începând cu ora 12.00.
Clubul a fost fondat în anul 2002 de către câțiva amatori de fotbal din Florești, iar oficial a fost înregistrat în anul 2003. Inițial a evoluat în competițiile raionale, iar în anul 2008 a început participarea în Liga 2. În 2015 președinte al clubului a devenit Vlad Manea, iar în ediția 2017, FC Florești a devenit campioană în Liga 2, seria Nord.
Formația de la Nordul Moldovei și-a continuat seria succeselor în anul 2019, când a devenit câștigătoarea Ligii 1, calificându-se în Super Liga. În primul sezon, 2020/21 s-a clasat pe locul 7 printre 10 participante, iar în sezonul 2021/22 a fost exclusă din campionat de Comitetul de Etică, fiind retrogradată în Liga 1.
În sezonul 2022/2023 a ajuns până în semifinala fazei play-off a Ligii 1, reușind să obțină un loc în Super Liga, datorită faptului că finalistele Dinamo-Auto și Victoria n-au primit Licență Națională. Astfel, FC Florești a revenit în Super Liga, după un an de absență, când a fost exclusă din campionat de către Comitetul de Etică al FMF, pentru manipularea meciurilor. Întrucât stadionul din Florești nu corespunde regulamentului Super Liga, ediția 2023/2024, partidele de acasă le-a disputat pe stadionul orășenesc din Bender.
Echipa antrenată de Nicolai Țurcan a încheiat prima parte a campionatului Super Liga, ediția 2023/2024, pe locul 7 din 8, cu 10 puncte în 14 meciuri jucate. Nicolai Solodovnicov este printre golgheterii campionatului cu 7 goluri la activ, fiind depășit doar de Radu Gînsari (Milsami) și Amine Talal (Sheriff) care au câte 8 reușite fiecare.
În același timp, căpitanul echipei, Maxim Mihaliov, a reușit să stabilească un nou record în fotbalul moldovenesc, depășind performanța anterioară deținută de Serghei Stroenco la numărului de meciuri jucate la nivelul elitelor. Mijlocașul în vârstă de 37 de ani a intrat în istorie în ultima etapă din prima fază a Superligii 2023/204, în confruntarea cu Milsami (1:0), consolidându-și poziția de lider cu impresionantul total de 446 de partide disputate.
FC Florești va continua să joace în Faza 2 a campionatului în Liga 1, Grupa 1, ca și Spartanii Sportul. Lor li se vor alătura alte 4 formații, cele mai bine clasate 2 echipe din fiecare grupă a Ligii 1 – FC Victoria, FC Speranța Drochia, CF Saksan și CF Univer. Astfel, cele 6 echipe vor juca în Faza secundă pentru calificarea (2 locuri) în Super Liga, sezonul 2024/25.
FC Florești a ajuns și în optimile Cupei Moldovei Moldtelecom 2024 unde a întâlnit formația FC Victoria. Timpul regulamentar s-a încheiat cu scorul de 1-1 (Nichita Picus 68 / Andrei Arabadji 39-penalty), dar învingătoarea s-a decis la loviturile de departajare, rezultat 4-5 pentru FC Victoria.